Đa số các bệnh viện chưa có cán bộ chuyên trách làm việc về quản lý chất lượng nên chất lượng các hoạt động thuộc tiêu chí Thiết lập hệ thống và cải tiến chất lượng theo bộ tiêu chí đánh giá chất lượng bệnh viện vẫn còn hạn chế. Cùng với đó, hội đồng quản lý chất lượng bệnh viện vẫn còn nặng về hình thức, chưa có những chỉ đạo sâu sắc, chưa có các hoạt động thiết thực và cụ thể nhằm nắm bắt những vấn đề hạn chế của bệnh viện để xây dựng kế hoạch cải tiến chất lượng một cách thực sự.

Các hoạt động để hình thành văn hóa chất lượng, giới thiệu hình ảnh và tạo thương hiệu của bệnh viện cũng chưa được thực sự quan tâm. Các tiêu chí về nguồn nhân lực, công tác dinh dưỡng, tiết chế, và quản lý cung ứng, sử dụng thuốc cũng không được đánh giá cao tại một số bệnh viện, nhất là tuyến huyện.