Nguyên nhân của những hạn chế trong công tác dân số được xác định là do tư tưởng trọng nam khinh nữ vẫn còn nặng nề ở một bộ phận cán bộ, đảng viên và nhân dân. Tổ chức bộ máy làm công tác dân số có nhiều biến động. Một số chính sách về dân số, kế hoạch hóa gia đình thiếu nhất quán, chưa đồng bộ. Một bộ phận nhân dân còn hạn chế hiểu biết về dân số, sức khỏe sinh sản, giới và bình đẳng giới.

Về chủ quan, một số cấp ủy đảng, chính quyền nhận thức chưa đầy đủ tầm quan trọng, ý nghĩa chiến lược của công tác dân số, còn xem nhẹ, buông lỏng công tác kiểm tra, giám sát và xử lý chưa nghiêm các hành vi vi phạm chính sách dân số, kế hoạch hóa gia đình. Công tác truyền thông về dân số, sức khỏe sinh sản có lúc, có nơi chưa thường xuyên, sâu sát đến từng nhóm đối tượng, nhất là nhóm đối tượng có nguy cơ làm tăng mức sinh trở lại.