Chế tài xử phạt vi phạm các quy định về ATVSTP hiện nay còn nhẹ, mức xử phạt thấp, chưa có quy định cụ thể về xử lý hình sự đối với các vụ việc nghiêm trọng.

Tính riêng trong năm 2016, cả nước có gần 680.000 vi phạm về ATVSTP nhưng chỉ có 20% cơ sở bị xử lý, mức phạt tiền trung bình khoảng 200.000 đồng một vụ. Bên cạnh đó, việc chồng chéo trong quản lý và kiểm tra về ATVSTP cũng đang gây phiền hà cho các cơ sở bị kiểm tra và khó khăn trong công tác quản lý của cơ quan chức năng.

Cùng với việc tăng nặng mức phạt đối với hành vi vi phạm ATVSTP, Thủ tướng Chính phủ cũng yêu cầu các Bộ, Ngành liên quan kiểm soát chặt việc sử dụng hóa chất bảo vệ thực vật, chất cấm trong chăn nuôi. Đối với UBND các cấp cần đưa nhiệm vụ bảo đảm an toàn thực phẩm vào chỉ tiêu phát triển kinh tế xã hội. Đồng thời, người đứng đầu phải chịu trách nhiệm chỉ đạo bảo đảm an toàn thực phẩm trên địa bàn.