Hội đồng Trường là tổ chức quản trị, đại diện quyền sở hữu của Nhà trường, có quyền quyết nghị các vấn đề mang tính chiến lược, quan trọng liên quan tới các hoạt động và sự phát triển của Nhà trường. Hội đồng trường Đại học Y dược Thái Bình có 19 đồng chí, gồm: Hiệu trưởng, các Phó Hiệu trưởng, Chủ tịch Công đoàn, đại diện một số khoa chuyên môn; đại diện Bộ Y tế; một số thành viên hoạt động trong lĩnh vực y tế, giáo dục, khoa học trong và ngoài tỉnh. 

Việc thành lập Hội đồng trường đánh dấu bước tiến của trường Đại học Y dược Thái Bình trong cơ cấu tổ chức, bộ máy lãnh đạo. Thời gian tới, Hội đồng trường sẽ tiếp tục xây dựng trường Đại học Y dược Thái Bình ngày càng đổi mới về quản lý, giáo dục và nghiên cứu khoa học, đóng góp tích cực vào sự nghiệp đào tạo nguồn nhân lực y tế chất lượng cao của tỉnh Thái Bình và trên cả nước./.

     Hà My