Những ưu đãi trong dự án này là, sinh viên tốt nghiệp sau khi đăng ký hồ sơ và được chọn sẽ được tuyển dụng vào làm việc các bệnh viện tuyến Trung ương. Sau đó, được cử đi học bác sĩ chuyên khoa I theo phương pháp đặc biệt 1 thầy 1 trò với hơn 70% thời lượng học là thực hành. Học xong, các bác sĩ được phân về vùng khó khăn với nhiều chế độ lương, phụ cấp ưu đãi; nam có thời gian phục vụ 3 năm, nữ thời gian 2 năm. Sau thời gian làm việc, họ sẽ quay trở lại các bệnh viện Trung ương đã được tuyển dụng trước đó khi tham gia dự án, hoặc các bệnh viện tại quê hương của bác sĩ, theo nguyện vọng.

Trường hợp bác sĩ trẻ đang tham gia dự án tự ý bỏ việc khi chưa đủ thời gian làm việc tại các huyện theo cam kết thì phải bồi thường kinh phí hỗ trợ ban đầu và kinh phí đào tạo kể từ khi tham gia dự án.