Nguyên nhân là do phần mềm quản lý KCB giữa các cơ sở KCB không đồng bộ. Trình độ tin học của cán bộ cơ sở y tế chưa đáp ứng yêu cầu. Chất lượng mạng có lúc không ổn định dẫn tới việc cập nhật thông tin của người bệnh chưa được kịp thời. Bên cạnh đó, một số danh mục kỹ thuật chưa có trong danh mục tương đương của Bộ Y tế dẫn tới nhiều vướng mắc.

Nhằm giải quyết khó khăn trên, BHXH tỉnh đang tích cực phối hợp hướng dẫn các cơ sở y tế chuẩn danh mục dùng chung, chuẩn dữ liệu để liên thông kết nối. Các doanh nghiệp công nghệ thông tin tiếp tục hỗ trợ tích cực cho các cơ sở y tế. Đồng thời, các cơ sở y tế cũng đang tích cực mở các lớp đào tạo, tập huấn và nâng cao tinh thần trách nhiệm của cán bộ công nghệ thông tin.